Действие разворачивается в обыкновенном японском городке Фуюки. В нем проходит смертельная война, скрытая от общества. Семеро магов, Мастеров, призывают души великих героев прошлого, называемых Слугами, которые сражаются между собой. Последний оставшийся обретет Святой Грааль, способный выполнить желание. Лишь некоторые знают про эту войну и Святой Грааль, но в этом году война начинается вновь.Главный герой - Эмия Широ, потерявший родителей в пожаре и усыновленный человеком, называвшим себя магом. Восхищаясь отчимом, он тренируется чтобы стать чародеем, однако, не обладая талантом, он едва ли может использовать один вид магии. Его отчим умер, и сегодня Широ маг без каких-либо умений и знаний. Он становится участником Войны Святого Грааля, когда случайно призывает Сэйбер - сильнейшую из Слуг...